1.0 物品、试剂:
10ul及200ul Tip头、0.2ml PCR薄壁管、管架、手套;
DEPC处理水、Ex-Taq试剂盒(包括PCR Buffer、MgCl2、Taq酶)、DNA Marker均另购,
引物/dNTP混合物(Primer/Nucleotide Mix)、阳性对照DNA (Positive Control DNA)、内标DNA (Internal Control DNA) 为普飞生物提供的VenorGem试用装中所含。
2.0实验方法:
2.1样品的准备:
样品:细胞的新鲜培养物上清,小牛血清。
分别取两种样品各100ul至灭菌1.5ml离心管中,将管盖盖紧。置95℃保温5分钟,短暂离心(5 sec)。
2.2 试剂的溶解配制:
将装有以下试剂干粉的离心管离心,向管中加入DEPC处理水,充分摇匀溶解后再短暂离心。以下为各组分的加水量:
引物/dNTP混合物 (Primer/Nucleotide Mix) 55ul
阳性对照DNA (Positive Control DNA) 50ul
内对照DNA (Internal Control DNA) 50ul
2.3 PCR混合物:
向0.2ml PCR薄壁管中依次加入以下组分,
|
PCR组分(单位:ul) |
负对照管 |
内对照管 |
阳性 对照管 |
牛血清 检测管 |
发酵液 检测管 |
|
水 |
28.8 |
26.8 |
24.8 |
24.8 |
24.8 |
|
10×PCR Buffer |
5 |
5 |
5 |
5 |
5 |
|
MgCl2( |
6 |
6 |
6 |
6 |
6 |
|
引物/dNTP混合物 |
10 |
10 |
10 |
10 |
10 |
|
内对照DNA |
- |
2 |
2 |
2 |
2 |
|
阳性对照DNA |
- |
- |
2 |
- |
- |
|
处理后样品 |
- |
- |
- |
2 |
2 |
|
Taq酶(5U/ul) |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
|
总体积 |
50 |
50 |
50 |
50 |
50 |
2.4热循环程序:
将准备好的PCR管放入PCR仪,运行如下程序
|
|
1个循环 |
|
|
35个循环 |
|
|
|
|
|
|
|
降温至4~ |
|
2.5凝胶电泳:
1.2%琼脂糖凝胶电泳,TBE缓冲液,PCR产物及Marker均点样5ul,于50V下电泳1hr,EB染色15min,紫外灯下观察。
3.0结果分析:
电泳结果见图。
图中泳道M为DNA Marker,1为负对照管PCR产物,2为内对照管PCR产物,3为阳性对照管PCR产物,4为牛血清检测管PCR产物,5为发酵液检测管PCR产物。
负对照管PCR产物无带,内对照管在191 bp处有一条带,阳性对照管在278 bp处有一条带,证明本次实验准确可靠。两样品检测管均只有一条与内对照管相同位置的条带,说明样品检测管PCR反应并未受到抑制,且不含支原体。