–TaqMan
TM–TaqManMGB
–Dual-oligoFRET pairs
–分子信标(Molecular beacons)
–ScorpionsTM/AmplifluorTM
1、TaqMan探针


TaqMan探针定量原理



共振能量转移

荧光共振能量转移(FRET)

当某个荧光基团的发射谱与另一个荧光基团的吸收光谱重叠,且两个基团距离足够近时,能量可以从短波长(高能量)的荧光基团传递到长波长(低能量)的荧光基团.
这个过程称为荧光共振能量转移(FRET),实际相当于短波长荧光基团释放的荧光被屏蔽。
2、TaqManMGB探针
MGB探针能够分辨1个碱基的差别
完全配对,有信号

一个碱基不配对,没有信号

TaqManMGB探针原理

MGB探针的优势

–提高信噪比 –没有背景荧光 –更高的淬灭效率 |
–提高Tm值15 mer 提高18°C –探针更短只要13-19个碱基 –更多一重PCR– |
两种探针比较

Cycle Number
ΔTm决定探针杂交特异性

C•ΔTm = Tm配对-Tm不配对
•要有效地区分等位基因,退火/延伸温度必须落在ΔTm区间内
3、分子信标(Molecular beacon)TaqMan
探针的衍生形式

4、杂交双探针
TaqMan探针的衍生形式

探针法小结
既灵敏又特异:PCR与分子杂交的结合
双倍放大:PCR放大与荧光放大的结合

•4种探针相比较,你更倾向于使用哪种?
SYBR Green I染料法
SYBR Green I是一种DNA小沟结合染料

SYBR Green I荧光染料
在PCR过程中染料与DNA结合发光

染料法小结
成本低
不需要探针
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