引物合成介绍及常见问题
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引物合成介绍及常见问题

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-03-07  本站论坛

PAGE

诊断PCR扩增

< 40base

OPC, PAGE

DNA测序

20base左右

OPC

亚克隆,点突变等

根据实验要求定

OPC, PAGEHPLC

基因构建(全基因合成)

根据实验要求定

PAGE

反义核酸

根据实验要求定

PAGE

修饰引物

根据实验要求定

PAGE, HPLC

6.最长可以合成多长的引物?

答:引物越长,出现问题的概率就越大。我们合成过120base的引物,但是产率很低。除非需要,建议合成片段长度不要超过80mer,按照目前的引物合成效率,80mer的粗产品,全长(还不一定正确)引物的百分比不会超过40%,后续处理还有丢失很多,最后的产量是很低。

7.需要合成多少OD数?

答:根据实验目的确定。一般PCR扩增,2 OD引物,可以做200-50050ul标准PCR反应。如果是做基因拼接或退火后做连接,1 OD就足够了。但是有些研究人员,就做几次PCR,但是却要5-10 OD。做全基因构建的引物都比较长,但是我们有些研究人员也要求高OD数。片段越长, 最后全长得率就越低,出错的几率就越大。超出需要之外的OD数要求,其实也是对社会资源的一种浪费,同时也从一个侧面反映了部分研究人员,特别是新手的自信心不足,总觉得需要重复多次才能成功。

 

8.如何检测引物的纯度?

答:实验室方便的作法是用PAGE方法。使用加有7M

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