PCR常见问题分析及解决方案
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  • 点击:    作者:   来源: 日期:2007-03-07    本站论坛

 

提高PCR特异性的策略

四种策略
1.巢式PCR(Nest-PCR)

2.递减PCR(TouchDown PCR)
–前几个循环使用严谨的退火条件提高特异性。
–循环设在比估算的Tm高大约5℃的退火温度下开始,然后每个循环降低1-2℃,直到退火温度低于Tm 5℃。
–特异性最高的目的模板会被优先扩增,这些产物在随后的循环中继续扩增占据优势。
–递减PCR对于那些不了解引物和目的模板同源性程度的方法更为有用,如AFLP、DNA指纹分析等。

3.热启动PCR(HotStart PCR)
热启动主要是通过抑制一种基本成分延迟DNA合成,直到PCR 仪达到变性温度
通常选择热启动Taq酶
热启动PCR是除了好的引物设计之外,提高PCR特异性最重要的方法之一

4.使用PCR增强剂

–甲酰胺,DMSO,甘油,甜菜碱等
–可能的机理:降低熔解温度,有助于引物退火,辅助DNA聚合酶延伸通过二级结构区
–增强剂浓度要适当

 


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