原位杂交(In situ Hybridization )
- 点击: 作者: 来源: 日期:2007-12-20 本站论坛
3. 0.1M甘氨酸:0.75g甘氨酸溶于0.1M PBS,定容至100ml,高压灭菌。
4. 4%多聚甲醛:多聚甲醛40g加ddH2O 400ml,加热至70℃左右,用1M NaOH调pH至7.0,用ddH2O定容至500ml,再加0.2M PB 500ml,总体积为1000ml。
5. 16×Denhardt溶液:聚乙烯吡咯酮0.4g、小牛血清白蛋白(BSA) 0.4g、聚蔗糖0.4g,加dd H2O至10ml,无菌抽滤、分装,-20℃保存备用。
6. 预杂交液:去离子甲酰胺10ml、50%硫酸葡聚糖4ml,于50℃促溶后,再依次加入16×Denhardt液0.2ml、1M Tris-HCl(pH 8.0) 0.2ml、5M NaCl 1.2ml、0.5M EDTA(pH 8.0) 0.04ml、0.1M二硫苏糖醇 2 ml、ddH2O 2.21ml,总体积为10ml。无菌抽滤、分装,-20℃保存备用。临用前加入50mg/ml变性鲑鱼精DNA 75μl/ml。
7. 20×SSC: NaCl 175.3g、柠檬酸三钠88.2g,加水至800ml,用2N NaOH调pH至7.0,再用ddH2O定容至1000ml。
8. 抗体稀释液:Triton X-100 80μl、BSA 0.2g,以0.05M PBS定容至20ml。
9. TSM1:1M Tris-HCl(pH 8.0)10ml、5M NaCl 2ml、1M MgCl2 1ml,加ddH2O 100ml。
TSM2(新鲜配制):1M Tris-HCl(pH 9.5)10ml、5M NaCl 2ml、1M MgCl2 1ml,加ddH2O至100ml。
显色液(临用前现配):5ml TSM2 加显色液原液(NBT/BCIP)150μl,并加适量左旋咪唑使其终浓度为0.24μg/ml,避光。
三、操作步骤
(一)取材、冰冻切片:
将动物以3%戊巴比妥钠麻醉,打开胸腔,暴露心脏,刺破右心耳,将针尖刺入左心室用生理盐水灌注(灌注量约为动物体重的2倍),再注入等量的4%多聚甲醛。(见图2-7)。取材,置于4%多聚甲醛中后固定4hr。以0.1M PBS浸泡冲洗4-5次(换液:1次/hr)。将组织块入30%蔗糖/0.1M PBS液(4℃),1-2天后冰冻切片,将切片裱贴于原位杂交专用玻片上,切片厚度为15-20μm。
(二)探针制备与检测(定量):
1.随机引物制备cDNA核酸探针
以DIG DNA 标记检测试剂盒为例:
(1)探针制备:
①模板DNA(0.5-3μg) 15μl,100℃变性10min,冰浴5 min。
②在冰浴中加:Hexanucleotide mix 2μl, dNTPmix 2μl, Klenow Enzyme 1μl,反应总体积为20μl。37℃孵育过夜。
③在上述20μl的标记产物中加4M LiCl 2.5μl, 75μl(无水乙醇预冷),轻轻混匀,-20℃放置 2hr。4℃离心12000g×15min,弃上清。70%乙醇(预冷) 50μl洗涤,7500g×5min,弃上清,晾干沉淀,加TE 50μl溶解沉淀,-20℃保存备用。
(2)探针敏感性检测:
①样品稀释:取dig-标记探针1μl 用ddH2O以1:10、1:100、1:1000、1:1000、1:10000梯度稀释。
②取一张与点样器大小相近的尼龙膜,标记方向,ddH2O中浸泡 1min,6×SSC中浸泡10min,置点样器上,负压抽吸5min。
③将上述样品点于尼龙膜上,继续抽吸10min。
④取下尼龙膜,置紫外灯下10cm处照射5min,晾干。