原位杂交(In situ Hybridization )
- 点击: 作者: 来源: 日期:2007-12-20 本站论坛
⑥加入Anti-dig 抗体(1:5000),37℃杂交30min。
⑦洗膜:2×SSC/0.1%SDS室温洗10 min×2次。
⑧显色:15 mlTSM2中加300μl显色液(NBT/BCIP),37℃避光显色30min。
1. PCR法制备cDNA核酸探针:
(1) 探针制备:
以PCR DIG Probe Synthesis Kit 为例:
在0.5ml离心管中,依次加入:
PCR 引物 1(10pM) 2μl
PCR 引物 1(10pM) 2μl
质粒DNA 模板(10-100pg) 2μl
PCR DIG mix 2μl
(含dNTP和DIG-11-dUTP)
dNTPmix 2μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl) 1μl
加入适量ddH2O,使总体积达50μl。
① 将上述混合液稍加离心,立即置PCR仪上,执行扩增。一般:在93℃预变性3-5min,进入循环扩增阶段:93℃ 45s → 58℃ 45s → 72℃ 60s,循环30-35次,最后在72℃ 保温7min。
② 在上述PCR产物中加入4M LiCl 12.5μl、预冷无水乙醇375μl,轻轻混合后置于-20℃2hr, 12,000g×15min,弃上清。70%乙醇(预冷) 120μl洗涤沉淀,离心7500g×5min,弃上清,晾干沉淀,加TE 50μl溶解,-20℃保存备用。
(2)探针检测:
行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察DIG-DNA探针含量(采用目测法)。
(三)原位杂交反应(以DIG-cDNA探针为例):
1.0.1M PBS (pH 7.2) 浸 5-10min。
2.0.1M甘氨酸/0.1M PBS 浸5min。
3.0.3%TritonX-100/0.1M PBS 浸10-15min。
4.0.1M PBS 洗 5min×3次,加蛋白酶K(1μg/ml),37℃孵育30 min。
5. 4%多聚甲醛浸5min。
6. 0.1M PBS 洗 5min×2次,浸入新鲜配制的含0.25%乙酸酐/0.1M三乙醇胺中10min。
7.预杂交:滴加适量预杂交液,42℃ 30 min。