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GenBank数据库简介

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-10-21  本站论坛

2、 完整基因组 :参见下面Genome和Maps部分,包括各种物种资源,人,小鼠,大鼠,酵母,线虫,疟原虫,细菌,病毒,viroids,质粒。
1) Entrez基因组 :提供了一个编码区的概要和各种物种的分类表(TaxTable)。编码区概要列出了在基因组中所有的的蛋白,并提供链接到FASTA文件和BLAST。分类表总结了蛋白BLAST分析的结果,建议他们的可能功能,并用颜色编码的图来显示物种同其它物种之间的关系(参见下面'Genomes和Maps,'部分Entrez基因组的一般描述)
2) FTP基因组蛋白 :从ftp站点的genbank/genomes目录下下载各种物种的FASTA格式的氨基酸序列*.faa和蛋白表文件*.ptt。参见readme文件。蛋白表也可以在Entrez基因组中看到。
3、 PROW : Web上的蛋白资源,关于大约200种人类的CD细胞表面分子的简短官方向导。互相检索,为每个CD抗原提供大约20中标准信息的分类(生化功能,配体,等等)
4、 BLAST : 将你的序列同蛋白库中的的序列比较,检索相似的序列。(更详细的信息见下面Tools/Sequence相似搜索部分)

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