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GenBank数据库简介

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-10-21  本站论坛

2) Entrez基因组 — 恶性疟原虫的染色体全长的图形视图,完整的染色体序列数据(2和3),链接到正在进行的染色体的分离数据表(来自于HB3 X Dd2杂交的染色体),链接到其他基因组测序中心。
3) FTP站点 (pub/Malaria目录):用于查找在DNA序列中STS的电子PCR疟原虫版。
4) FTP站点 (genbank/genomes 目录):下载各种格式的完整的染色体序列数据(2和3),包括GenBank的flat file (*.gbk),GenBank的概要文件(*.gbs),FASTA核酸文件(*.fna),FASTA氨基酸文件(*.faa),蛋白表(*.ptt)和其他。
8、 细菌基因组
1) Entrez基因组 — 完整细菌基因组的图形表示,可以整个的查看,也可以逐步放大的看。链接到相关的序列数据。对每一个细菌都提供了一个编码区域的概要和TaxTable。
2) 微生物基因组测序计划:完成的和正在进行的测序计划,链接到NCBI的图形视图和测序中心。
3) COGs :相邻类的聚簇 — 来自于完整基因组的基因家族自然系统。COGs用比较21种完整的基因组的编码的蛋白序列描绘了17个主要的种系发生系统。每个COG包含至少来自3个世系的独立蛋白或蛋白家族的相邻体,所以对应了一个古老的保守domain。
4) FTP站点: 下载各种格式的完整的细菌染色体序列数据,包括GenBank的flat file (*.gbk),GenBank的概要文件(*.gbs),FASTA核酸文件(*.fna),FASTA氨基酸文件(*.faa),蛋白表(*.ptt)和其他。
5) 微生物基因组BLAST数据库 :与完成的和未完成的微生物基因组进行BLAST

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