关于提交序列数据,收到 accession number,和对纪录作更新的一般信息。 BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。(请在提交前用 VecScreen 去除载体) Sequin - 提交软件程序,用于一条或者很多条的提交,长序列,完整基因组,alignments,人群/种
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  • 向GenBank提交数据

  • 点击:    作者:   来源: 日期:2007-12-16    本站论坛
· 关于提交序列数据,收到 accession number,和对纪录作更新的一般信息。

· BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。(请在提交前用 VecScreen 去除载体)

· Sequin - 提交软件程序,用于一条或者很多条的提交,长序列,完整基因组,alignments,人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用,或者用基于TCP/IP的"network aware"模式,可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。(请在提交前用VecScreen去除载体)

· ESTs - 表达序列标签,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和 RACE 实验的 cDNA 序列。

· GSSs - 基因组调查序列,短的、单次(测序)阅读的cDNA序列,exon trap 获得的序列,cosmid/BAC/YAC 末端,及其他。

· HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列,未完成的(阶段0,1,2)和完成的(阶段3)序列。(注意:完成的人类的HTG序列可以同时在 GenBank 和 Human Genome Sequencing页面上访问。)

· STSs - 序列标签位点。短的在基因组上可以被唯一操作的序列,用于产生作图位点。

· 注:SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中(dbSNP)。

1)先登陆:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html

2)收到邮件,编辑,提交序列。

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