六. 互补效应
香碗豆有紫花品系（PPCC）和白花品系(ppcc)，杂交的F1代皆为紫花（PpCc）,自交后F2代，只有紫花 (P_C_) 和白花 (P_cc,C_cc,ppcc) 两种表形，比例为9:7（图4-20a当然也是9:3:3:1之比的变形。也就是说只有当C，P基因都正常时才开紫花。这是由于紫色素的合成是经过了一系列的连锁反应，无论是C基因还是P基因发生突变，此反应都不能完成，而中间产物是白色的, 所以只有C_P_ 基因型呈紫色，其余基因型皆为白色(图4-21)。这种类型称互补效应（complement effect）。和隐性上位不同的是其中间产物是没有产生色素（无色），在这种类型中C和P两个座位只要其中一个座位以隐性状态存在，对另一个基因都能起到异位显性的作用，故也称为双隐性上位（double recessive epistatic）
七. 显性上位
显性上位产生3种表型，比例为12:;3:1，但产生这种比例的机制可能有不同的途径，一种是抑制基因所引起的。在植物中有一种可用于治疗心脏病的植物叫毛地黄（Digitalis purpuread）是一个很好的例子（图4-24）毛地黄的M等位基因控制合成红色花花色素苷。D为修饰基因，它控制合成大量的花色素苷，花呈深红；d只能控制合成少量的花色素苷，花呈浅红。W座位控制花色素在花冠上的不同分布。W等位基因使红色色素只分布于筒状花的喉部，其余部位不分布。w基因使花色素分布于整个花冠。所以DdWw的表型为白色花喉部带红点，D_ww表现为既有大量的红色素，又能分布于整个花冠，故呈深红；ddww仅有少量红色色素，也能广泛分布，花为浅红色。以上可以看出，只在显性基因W的存在，无论是D还是d，都为白色带红点，也就是说当W为显性时对另一个基因呈异位显性，也就称为显性上位（dominant epistasis）。
另一种类型的显性上位的分离比也是12:3:1，但机理不同，如南爪的皮色有白色，黄色绿色三种，遗传的规律（如图4-25）。产生的机制是由于W等位基因是一个抑制基因（inbibitor）作用的结果，原来产生黄色色素要经过两步生化反应（图4-26）当W基因存在时可以抑制G基因的表达，结果爪呈白色。若W突变为w，则失去了抑制作用，反应可以顺利进行，直到产生黄色的色素，当Y突变为y时，则不能形成黄色色素，爪呈绿色。结果也同样会出现12:3:1的分离比。
时表达，其结果是深色掩盖了浅色。如燕麦颖片颜色的遗传，当黑色颖片和白色颖片的品系杂交F1代为黑颖，F1自交后F2产生三种表型，黑颖、黄颖和白颖，比例也为12:3:1（图4-28），产生的原因是（图4-27）黑色掩盖了浅色。
B存在时，即使
Y也存在，由于黑色产生掩盖了黄色，表型仍为黑色，只有
b存在时
Y表型才呈黄色，
bbyy时既不能产生产生黑色素，也不能产生黄色色素，所以为白色。
八．抑制效应
另一种重要的互作是抑制基因（suppression gene）。此是一个基因抑制另外一个基因的表达，但其生化途经和显性上位不同。在报春花属（Primula）中K基因可以控制合成一种黄色的锦葵色素，但另一个D基因存在时可抑制其表达（图4-29）。
因此KKdd为黄色，KKDD为白色，二者杂交的F1代为白色KkDd；F2代出现两种表型白色和黄色分离比为13:3(图4-30)。以上八种不同类型的基因互作可以归纳为表4-9。
