Forces shaping the fastest evolving regions in the human genome

Forces shaping the fastest evolving regions in the human genome

题目]：Forces shaping the fastest evolving regions in the human genome
[作者]：Pollard KS,Salams SR,King B,Kem AD,Dreszer T,et al.
[日期]：2006 10
[期卷]：Volume 2 Issue 10
[杂志]：Plos Genet

首先介绍一下，Plos系列的杂志也是相当不错的，上面有很多高质量的基础文章，且免费。
这篇文章通过基因组的比较，在Chimp,mouse,rat当中发现了34498段长度大于100bp,相似度大于96%的片段(在于人类亲缘关系更远的物种中，他们也同样保守)，这些片段19.6%分布在编码区，其余在非编码区，其中有202个区域与人的差异特别的大，也就是他们在人和猩猩分歧后，进化速度濡染加快（只有1.5%在编码区）。对前5个区域分析，发现伴随着进化速度的加快，ATtoGC的偏好越来越强，却越接近染色体的端粒(第4个例外，且coding区与noncoding区都存在这种偏好)。第1、2个正选择检验结果显著。进化速度越快，周围重组率越高。最后的结论是很多因素导致了一部分区域的快速进化。

tips:BGC只能影响hunderds of bp，而the domain of selection in a sweep can be tremendous.另外有一种叫做selected-isochore model的东西可以影响hundreds of kb的，它的核心是说通过GC含量的升高来维持isochore的结构。