| DNA分子标记在植物生物技术中的应用
遗传标记概述
DNA分子标记概述
DNA分子标记的主要类型
DNA分子标记在植物生物技术中的应用
PCR技术及在植物分子生物学中的应用
利用RAPD分子标记对三组三系杂交水
稻及亲本的遗传分析和鉴定
遗传标记概述
遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征。
在经典遗传学中，遗传多态性是指等位基因的变异。在现代遗传学中，遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异。
遗传标记的发展
DNA分子标记概述
DNA分标记是近年来发展起来的一种分子生物学新技术。
在经典遗传学中通常将可识别的等位基因称为遗传标记，其类型主要包括形态标记、细胞学标记和同工酶标记。这些遗传标记在遗传学的建立与发展过程中起了重要作用，但这三种标记的数量较少，且都是以表现型为基础的，是对基因的间接反应。因而它们在现代遗传学的研究和应用中表现出极大的局限性。
随着分子生物学技术的发展，人们建立了各种DNA分子标记技术，从而使遗传标记的范围大为拓宽。
在现代遗传学中，遗传标记是指基因组中任何座位上的相对差异。本讲座对DNA分子标记技术的优点、主要类型及其在植物遗传育种上的应用作一概述。
DNA分子标记是指在DNA分子水平上，通过一定方式或特殊手段来反映生物个体之间或种群之间具有差异性状的DNA片段。
DNA分子标记是建立在DNA序列多态性基础之上的，它是基因的直接反应。与经典的遗传标记相比，DNA分标记具有无与伦比的优越性：
1. 极大的丰富性
2.多态性高，变异类型丰富。
3. 大多数DNA标记是共显性的
4. DNA标记对性状的表达没有影响
5. DNA标记具有很高的稳定性
DNA分子标记的主要类型
在遗传学研究中广泛应用的DNA分子标记已经发展了很多种，一般依其所用的分子生物学技术大致可以分为两大类：
一类是以Southern杂交技术为核心的分子标记，（如RFLP），这类分子标记被称为第一代分子标记。
一类是以PCR技术为核心的分子标记，（如STS、RAPD、AFLP、SSR）等，这类分子标记被称为第二代分子标记；
单核苷酸多态性（SNP）标记被称为第三代分子标记 。它也是以以PCR技术为基础的分子标记技术。
主要的ＤＮＡ分子标记
RFLP标记:
RFLP标记是发展最早的DNA标记技术。RFLP是指基因型之间限制性片段长度的差异，这种差异是由限制性酶切位点上碱基的插入、缺失、失重排或点突变所引起的。
RFLP技术主要包括以下基本步骤：
DNA提取→用限制性内切酶酶切DNA→用凝胶电泳分开DNA片段→把DNA片段转移到滤膜上→利用放射性标记的探针杂交显示特定的DNA片段（Southern杂交）和结果分析。
RFLP遍布整个基因组，并且非常稳定，但RFLP实验操作繁琐，检测周期长，成本高昂，不适于大规模的分子育种，在植物分子标记辅助育种中需要将RFLP转换成以PCR为基础的标记。
STS标记：
STS是由特定引物序列所界定的一类标记。
在生物的基因组中常存在大量的单拷贝序列，根据单拷贝DNA两端的序列设计特异引物对基因组DNA进行PCR扩增，所产生的一段序列在基因组
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